Chen,Chi-MingPersonal data of - Department of Physics, NTNU

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Name	Chen,Chi-Ming
Office_Hour	（週一）10:00-12:00（週二）13:00-15:00
Office phone number	02-77496039
Fax	02-29326408
E-mail	cchen@phy.ntnu.edu.tw
Personal website	http://phy.ntnu.edu.tw/~cchen/
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Education	Ph. D., University of Michigan, USA

Category	Full-Time Faculty
Job title	Professor
Research Fields	Membrane Protein Folding. Synchronized Activities of Neuron Networks. Biomembranes Polymer Physics
Research expertise	Biophysics、condensed matter physics
Laboratory	/

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Journal papers
1. 陳啟明(2019/06)。SeQuery: An Interactive Graph Database for Visualizing the GPCR Superfamily。Database: The Journal of Biological Databases & Curation。
2. 陳啟明(2019/01)。Unsupervised cluster analyses of character networks in fiction: Community structure and centrality。Knowledge-Based Systems。
3. 陳啟明(2017/11)。Visualizing the GPCR Network: Classification and Evolution。Scientific Reports，7(15495)。
4. 陳啟明(2017/01)。SynchronizationandInter-LayerInteractionsofNoise-DrivenNeuralNetworks。Frontiers in Computational Neuroscience，11(2)。
5. 陳啟明(2016/01)。Visualizing and Clustering Protein Similarity Networks: Sequences, Structures, and Functions。J. Proteome Res.，15(7)。
6. 陳啟明(2016/01)。Visualizing the World's Scientific Publications。Journal of the Association for Information Science and Technology，67(10)。
7. G.-M. Hu, T.-L. Mai, and C.-M. Chen*, 2015, “Clustering and visualizing similarity networks of membrane proteins”, Proteins: Structure, Function and Genetics, 83,1450–1461.。
8. 陳啟明(2015/01)。Visualizing the clustering of financial networks and profitability of stocks。Journal of complex networks，3(2)。
9. T.-L. Mai and C.-M. Chen*, 2014, “Computational Prediction of Kink Properties of Helices in Membrane Proteins”, J. Comput. Aid. Mol. Des., 28 99-109.。
10. 陳啟明(2012/12)。Monte Carlo simulations of single and coupled synthetic molecular motors。Phys. Rev. E，86(5)。
11. 陳啟明(2012/09)。Statistical Analyses and Computational Prediction of Helical Kinks in Membrane Proteins。J. Comput. Aid. Mol. Des.，26(10)。
12. 陳啟明(2012/01)。Replica Exchange Monte-Carlo Simulations of Helix Bundle Membrane Proteins: Rotational Parameters of Helices。J. Comput. Aid. Mol. Des.，26(3)。
13. 陳啟明(2011/11)。Synchronization in a Noise-driven Developing Neural Network。Phys. Rev. E，84(5)。
14. 陳啟明(2011/09)。Classification and Visualization of the Social Science Network by the Minimum Span Clustering Method。J. Am. Soc. Inform. Sci. Tec，62(12)。
15. 陳啟明(2009/01)。A dual-scale approach toward structure prediction of retinal proteins。JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY，165(1)。
16. 陳啟明(2008/12)。Classification of Scientific Networks Using Aggregated Journal-Journal Citation Relations in the Journal Citation Reports。JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR INFORMATION SCIENCE AND TECHNOLOGY，59(14)。
17. 陳啟明(2008/05)。Packing of transmembrane helices in bacteriorhodopsin folding: Structure and thermodynamics。Journal of Structural Biology，162(2)。
18. 陳啟明(2007/04)。Driven polymer transport through a nanopore controlled by a rotating electric field: Off-lattice computer simulations。THE JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS，126(14)。
19. 陳啟明(2007/04)。Contact-induced structure transformation in transmembrane prion propagation。BIOPHYSICAL JOURNAL，92(8)。
20. 陳啟明(2006/01)。Visualizing the scientific world and its evolution。JOURNAL OF THE AMERICAN SOCIETY FOR INFORMATION SCIENCE AND TECHNOLOGY，57(11)。
Research projects
1. 陳啟明(2020/08/01-2021/07/31)。複雜網絡的統計分析與機器學習(2/3)。科技部(原國科會)。(MOST 109-2112-M-003-003)。主持人。
2. 陳啟明(2019/08/01-2020/07/31)。複雜網絡的統計分析與機器學習(1/3)。科技部(原國科會)。(MOST 108-2112-M-003-008)。主持人。
3. 陳啟明(2018/08/01-2019/07/31)。複雜網絡的計算研究與統計分析。科技部(原國科會)。(MOST 105-2112-M-003 -003 -MY3)。主持人。
4. 陳啟明(2017/08/01-2018/07/31)。複雜網絡的計算研究與統計分析。科技部(原國科會)。(MOST 105-2112-M-003 -003 -MY3)。主持人。
5. 陳啟明(2016/08/01-2017/07/31)。複雜網絡的計算研究與統計分析。科技部(原國科會)。(MOST 105-2112-M-003 -003 -MY3)。主持人。
6. 陳啟明(2015/08/01-2016/07/31)。複雜系統的統計分析與電腦模擬。科技部(原國科會)。(NSC 102-2112-M-003 -010 -MY3)。主持人。
7. 陳啟明(2014/08/01-2015/07/31)。複雜系統的統計分析與電腦模擬。科技部(原國科會)。(NSC 102-2112-M-003 -010 -MY3)。主持人。
8. 陳啟明(2013/08/01-2014/07/31)。複雜系統的統計分析與電腦模擬。國科會。(NSC 102-2112-M-003 -010 -MY3)。主持人。
9. 陳啟明(2012/08/01-2013/07/31)。Computer Simulations of Complex Systems。國科會。(NSC 99-2112-M-003 -011 -MY3　)。主持人。
10. 陳啟明(2011/08/01-2012/07/31)。Computer Simulations of Complex Systems。國科會。(NSC 99-2112-M-003 -011 -MY3)。主持人。
11. 陳啟明(2010/08/01-2011/07/31)。複雜系統的電腦模擬研究。國科會。(99-2112-M-003-011-MY3)。主持人。
12. 陳啟明(2010/08/01-2011/07/31)。複雜系統的電腦模擬研究計畫設備。國科會。(NSC 99-2738-M-003-003-)。主持人。
13. 陳啟明(2009/08/01-2010/07/31)。電腦研究在複雜系統的一些應用。國科會。(97-2112-M-003-005-MY2)。主持人。
14. 陳啟明(2008/08/01-2009/07/31)。電腦研究在複雜系統的一些應用。國科會。(97-2112-M-003-005-MY2)。主持人。
15. 陳啟明(2007/08/01-2008/07/31)。穿膜蛋白質的結構預測(3/3)。國科會。(NSC 96-2112-M-003 -002)。主持人。
16. 陳啟明(2006/08/01-2007/07/31)。穿膜蛋白質的結構預測(2/3)。國科會。(NSC 95-2112-M-003 -005)。主持人。
17. 陳啟明(2005/08/01-2006/07/31)。穿膜蛋白質的結構預測。國科會。(NSC 94-2112-M-003 -012)。主持人。
18. 陳啟明(2004/08/01-2005/07/31)。蛋白質摺疊的非晶格電腦模擬(2/2)。科技部(原國科會)。(93-2112-M-003-004-)。主持人。
19. 陳啟明(2003/08/01-2004/07/31)。蛋白質摺疊的非晶格電腦模擬(1/2)。科技部(原國科會)。(92-2112-M-003-005-)。主持人。
20. 陳啟明(2002/08/01-2003/07/31)。生物高分子的蒙地卡羅電腦模擬(2/2)。科技部(原國科會)。(91-2112-M-003-023-)。主持人。
21. 陳啟明(2001/08/01-2002/07/31)。生物高分子的蒙地卡羅電腦模擬(1/2)。科技部(原國科會)。(90-2112-M-003-024-)。主持人。
22. 陳啟明(2000/08/01-2001/07/31)。高分子及薄膜的理論研究和蒙地卡羅電腦模擬(3/3)。科技部(原國科會)。(89-2112-M-003-038-)。主持人。
23. 陳啟明(1999/07/01-200008/01)。高分子及薄膜的理論研究和蒙地卡羅電腦模擬(2/3)。科技部(原國科會)。(89-2112-M-003-017-)。主持人。
24. 陳啟明(1998/08/01-1999/07/31)。高分子及薄膜的理論研究和蒙地卡羅電腦模擬研究(1/3)。科技部(原國科會)。(88-2112-M-003-012-)。主持人。
Others
1. 陳啟明(2006-5)。基礎物理(1)。台灣：勁園文化事業股份有限公司。986725146-6。

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